В большинстве случаев выбор антибиотиков приходится делать из результатов посева. Поэтому очень важно, чтобы применяемые антибиотики были эффективны против большинства микроорганизмов, которые могут быть наиболее вероятной причиной развития инфекции у новорожденного. Основное внимание необходимо уделять бактериальным инфекциям, заражение которыми происходят в утробе матери или во время родов; их возбудителями являются микроорганизмы, относящиеся к нормальной кишечной флоре матери (колиформные микроорганизмы, стрептококки группы В). Пенициллиноустойчивые стафилококки и Pseudomonas aeruginosa редко являются возбудителями врожденных инфекционных заболевании.
Заражение ими происходит в постпатальном периоде. Если симптомы заболевания возникают лишь через 48—72 ч после рождения младенца, следует помнить о возможности развития инфекций, вызванных именно этими возбудителями. Общая эффективность некоторых антибиотиков со временем снижается. Около двух десятилетий тому назад стрептомицин обладал высокой активностью против инфекционных заболеваний, вызванных колиформыыми микроорганизмами, но в последнее время его эффективность резко снизилась, и он был заменен канами-ципом (кантрекс). В настоящее время активность канамицина против Е. coli заметно снизилась. В те годы, когда его только начали применять, канамицип был эффективен против 90—95% штаммов Е. coli; в настоящее время, по некоторым данным, он убивает приблизительно 60% штаммов. В начальные периоды применения как канамицин, так и стрептомицин были эффективны также и против стафилококков, но и эта их эффективность также была вскоре утеряна. Снижение активности этих препаратов связано с их широким использованием. В настоящее время удовлетворительным заменителем канамицина является гентамицип (гарамицин). Интересно, что он также эффективен против пеницилли-ноустойчивых стрептококков и против по меньшей мере 90% штаммов Е coli.
Гентамицин эффективен также против Pseudomonas aeruginosa, поэтому он имеет преимущество перед другими препаратами в лечении бактериальных инфекций. Более двух десятилетий пенициллин остается эффективным средством против большинства штаммов стафилококков, заражение которыми происходит за пределами больницы, стрептококков. Однако в настоящее время пенициллин все чаще заменяют ампициллином, поскольку он эффективен не только против всех тех микроорганизмов, что и пенициллин, но также и против большинства штаммов. На стафилококки, которые резистентны к пенициллину, необходимо воздействовать нафциллином или подобными ему препаратами, обладающими специфической активностью против неустойчивых штаммов стафилококков. Инфекционные заболевания, проявляющиеся в течение первых часов жизни, лучше всего лечить канамицином или гентамициномв сочетании с ампициллином, поскольку заражение этими инфекциями, по-видимому, происходит во внутриутробном периоде. Инфекционные заболевания в более позднем периоде возникают вследствие внутрибольничного заражения. Для лечения этих инфекций применяют сочетание полимиксина и нафцилина или гентамицина.